为打造多学科相互交融的高端智库，服务国家实施乡村振兴战略，加快国家农业农村现代化建设，北京大学成立“北京大学新农村发展研究院”（以下简称“研究院”），挂靠北京大学现代农学院。
研究院以加快农业农村现代化建设、推动乡村全面振兴和早日全面实现农业强、农村美和农民富的目标为宗旨，瞄准学科前沿问题和国家重大需求，开展基础性、前瞻性和系统性的战略研究和咨询服务，建成国内外享有盛誉的农业农村发展高端智库，同时推进中国农村转型经济与政策的成功经验在亚洲和非洲等发展中国家的应用，提升中国在国际上的影响力。
研究院设理事会、顾问委员会和执行机构。理事会是研究院的最高决策机构，负责制定研究院的发展方向，指导研究院的运行与管理，解决发展中遇到的主要问题，审议年度工作报告。顾问委员会是研究院的政策和学术咨询机构，指导研究院的研究和咨询工作，协助扩大研究院的学术和政策影响。研究院实行院长负责制，全面负责研究院的日常工作。
研究院设四个研究部门：农业发展研究部、城乡统筹研究部、资源环境研究部、北大-地方乡村振兴研究基地。
设立综合办公室，为研究部的工作提供行政协调服务。
北京大学新农村发展研究院
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