| 姓名： 宋晓峰 | 性 别: 男 | 行政职务 : 系副主任 | |||||||
| 专业技术职务： 教授 | 办公电话： 84891938-602 | 导师类别： 博士生导师 | |||||||
| 最后学历： 博士毕业 | 最后学位： 博士 | 最后毕业学校： 浙江大学 | |||||||
| 电子邮件： xfsong@nuaa.edu.cn | |||||||||
| 工作单位： 自动化学院 | |||||||||
| ◇ 主学科研究方向： | |||||||||
| 二级学科名称（主）： 精密仪器及机械 （招收博、硕士研究生） | 学科代码11： 080401 | ||||||||
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1、生物信息的处理与建模。 2、计算系统生物学理论与算法。 目前本课题组主要采用计算系统生物学研究手段研究人类复杂疾病的分子调控机制，诸如miRNA介导的人类疾病基因表达调控机制，相关蛋白降解异常所致疾病的分子机制，为相关疾病的诊断和治疗提供帮助等。 |
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| ◇ 个人简历（学历、学术经历及社会兼职）： | |||||||||
| 宋 晓峰教授2003年7月毕业于浙江大学控制理论与控制工程专业，获博士学位，2011年5月晋升教授。主要研究领域为生物信息学与计算系统生物学。近几年 主持国家自然科学基金一项、江苏省自然科学基金一项，主持校级教改项目三项，参与国家级或部级科研项目十多项，以第一作者或通讯作者在国际著名SCI检索 学术期刊Nucleic Acids Research, Journal of Theoretical Biology, Journal of Medical Virology, BioSystems等发表论文14篇，EI、ISTP收录论文30多篇。多次参与组织和参加国内国际学术会议。目前担任：中国生物医学物理学研究会理 事；中国电子学会生命电子学专业委员会委员；江苏省生物医学工程学会生物信息学专业委员会委员；Nucleic Acids Research, Computers in Biology and Medicine等多个国际杂志的审稿人，多个国际学术会议(WCCI2008, ACM BCB2011, BSBT2011，BSBT2010，BSBT2009，BSBT2008, IEEE BIBM2010, IEEE BIBM2011, IJCBS2009, AST2010, ICCC2010，ICCC2009)程序委员会委员，主席，分会主席等。 | |||||||||
| ◇ 发表学术论文,出版专著情况： | |||||||||
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以 第一作者或通讯作者在国际著名SCI检索学术期刊Nucleic Acids Research, Journal of Theoretical Biology, Journal of Medical Virology, BioSystems等发表论文14篇，EI、ISTP收录论文30多篇。 (1)Xiaobai Zhang, Juan Cui, Daniel Nilsson; Kapila Gunasekera; Isabel Roditi; Astrid Chanfon; Xiaofeng Song, Huinan Wang, Ying Xu and Torsten Ochsenreiter. The Trypanosoma brucei Mitocarta and its Regulation and Splicing Pattern during Development. Nucleic Acids Research. 2010,38(21):7378-7387. (SCI# 689TK, IF# 7.279) (2)Xiaofeng Song, Lei Cheng. microDoR: Predicting miRNA-Mediated Gene Silencing, mRNA degradation or translational repression. Comput. Biol. Med.. (to appear, 2011) （SCI, IF#1.485） (3)Xiaofeng Song, Hao Jia, et.al.Recognition of short-lived proteins based on sequence-derived features in eukaryotic cell. PLoS ONE. (to appear, 2011) （SCI, IF#4.78） (4)Xiaofeng Song, Peipei Wang.Flexible Array Self-Organizing Map Neural Network and Its Application in Complex Pattern Recognition. Neural Computing and Application, 2011,20(1):9-16. (SCI# 712NZ, IF# 1.088) (5)Xiao-feng Song, Wei-min Chen, Yi-Ping Phoebe Chen, Bin Jiang. Candidate Working Set Strategy based SMO Algorithm in Support Vector Machine. Inform. Process. & Manag. 2009,45(5): 584-592.（SCI# 481FP, IF# 2.106）（corresponding author） (6)Xiao-feng Song, Yan Hao. Adaptive Evolution of Rotavirus VP7 & NSP4 Genes in Different Species. Comput. Biol. Chem. 2009, 33(4): 344-349.（SCI# 495BM, IF# 1.733）（corresponding author） (7)Xiao-feng Song，Ping Han，Yi-Ping Phoebe Chen. Genetic variation of the hemagglutinin of avian influenza virus H9N2. J. Med. Virol. 2011,83(5):838-846.（SCI#736BL, IF# 2.572） (8)Xiao-feng Song，Saman K Halgamuge, CHEN De-zhao, HU Shang-xu, and Bin Jiang. The Optimized Support Vector Machine with Correlative Features for Classification of Natural Spearmint Essence. Int. J. Innov. Comp. Inf. Con., 2010, 6(3): 1089-1099, (SCI# 571PW, IF#2.735) （corresponding author） (9)Xiaofeng Song, Chen,Weimin, Jiang,bin. Sample reducing method in Support Vector Machine based on K-closed Sub-clusters, Int. J. Innov. Comp. Inf. Con.，2008,4(7):1751-1760 (SCI#326XS, IF#2.735) （corresponding author） (10)Xiaobai Zhang. Xiaofeng Song, Huinan Wang. Sequential Local Least Squares Imputation Estimating Missing Value of Microarray Data. Comput. Biol. Med., 2008,38(10): 1112-1120. (SCI#368QN, IF#1.485) （corresponding author） (11)Xiaobai Zhang. Xiaofeng Song, Huinan Wang。Characteristic comparison between two types of miRNA precursors in metazoan species。BioSystems,2010,100(2):144-149. (SCI# 599MX, IF#1.653）（corresponding author） (12)Zhang huanping, Xiaofeng Song, Huinan Wang, Xiaobai Zhang. MIClique: An Algorithm to Identify Differentially Coexpressed Disease Gene Subset from Microarray Data. J. Biomed. Biotechnol.. 2009, doi:10.1155/2009/642524（SCI#560FT, IF#2.647）（corresponding author） (13) Minghao Wang, Xiaofeng Song，Ping Han, Wei Li, Bin Jiang. New syntax to describe local continuous structure-sequence information for recognizing new pre-miRNAs. Journal of Theoretical Biology. 2010,264(2):578-584.（SCI# 588GG, IF#2.738）（corresponding author） (14) Hui Yi, Xiaofeng Song, and Bin Jiang. Structure Selection of Support Vector Machine based on Decision Directed Acyclic Graph based on Misclassification Loss Minimization. Int. J. Innov. Comput. I..2011, 7(9) (accepted) （co-corresponding author） |
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| ◇ 承担的科研项目情况： | |||||||||
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主持国家自然科学基金（No.61171191）； 主持江苏省自然科学基金（BK2010500）； 主持校级教改项目三项； 参与国家级或部级科研项目十多项； |
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| ◇ 指导研究生情况： | |||||||||
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目前指导硕士研究生9名，协助指导博士研究生2名。 已毕业研究生12名，分别进入德国博世、西门子、华为、中兴等世界500强公司企业从事软件工作，本课题组毕业的博士生进入同济大学、南京林业大学等著名高校工作。 本课题组已经与美国、澳大利亚、香港等地高校建立密切的合作关系，在校期间，优秀的研究生将有机会进入美国，香港等高校进行合作研究。 |
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| ◇ 备注： | |||||||||
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课题组主页：http://bioinfo.nuaa.edu.cn |
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