本专业师资力量雄厚，主要为海外引进人才及共建单位的知名学者等25位教师，其中教授13名（均为博士生导师）包括国家973首席科学家1名、上海市领军人才1名、国家杰出青年基金获得者2名、教育部新世纪优秀人才3名、校特聘教授5名、校讲座教授5名；副教授8名，讲师7名。学科分布涉及生物物理化学、药物设计、药物化学、药物筛选、药理学、化学生物学等。现正承担国家973计划、863计划、国家自然科学基金、教育部新世纪优秀人才支持计划、上海市浦江人才计划、上海市科委重点基础研究等科研项目40余项。
主要学科带头人蒋华良教授是我国著名的药物化学家，国家973计划首席科学家，中国科学院上海药物研究所副所长、药物发现与设计中心主任，药学院现任院长；钱旭红教授是我国著名的农药学专家，国家973计划首席科学家，华东理工大学现任校长。
本专业的特色主要有三个：一是遵循从基因到药物的原理，培养学生从源头入手（从基因入手和从小分子化合物入手）进行创新药物研究的能力。二是理工结合，与国外大学药学教育模式相一致。既充分发挥华东理工大学在化学、化工、生物、生工以及制药工程、中药现代化工程、农药等学科专业的独特优势，同时又依托中国科学院上海药物研究所创新药物研究的强大实力，以培养研究型药学人才为主又具有理工结合的特色。三是强调国际性。借助于本专业师资力量所具备的年轻（大都是40岁左右）、高学位（大都是博士）、国际化（大都具有海外留学经历）等特点，吸收国内外先进教学经验，努力提高药学学科建设的国际化水平；从三年级开始，实行本科生导师轮流制，通过真正接触课题研究来培养学生个性化学习兴趣；同时经常邀请国外专家来华进行短期讲学，使学生们尽早接触学科国际前沿，使学生在语言和专业方面具备国际交流能力。
本专业的主干学科是化学、生物学和药学。主要课程包括：现代基础化学、有机化学、物理化学、生物化学、药物化学、天然药物化学、微生物学、分子生物学、药理学、药物分析、药物筛选、药物设计学、药学文献检索、药学专业实验等。
本专业毕业生的主要去向有：出国或报考药学或相关专业的研究生，进一步深造；可到科研院所或制药企业从事新药研究或药品检验；可到相关院校从事药学教学等。
